印尼的含煤地层属始新世到上新世。始新统一样为陆相砾岩与砂岩。中巨港层包含中新统上部—上新统下部地层，总厚1200m，由泥质岩、海绿石砂岩、凝灰质砂岩组成，含有褐煤和含油层。上巨港层由凝灰岩与凝灰砂岩组成，夹有薄煤层和班脱岩。含煤地层变位轻微，倾角很少超过20。
在各个岛上有工业意义的含煤层位不同。始新统中的煤为黑色致密烟煤，至上新统中变为次烟煤。在更年青的侵入运动影响下，除烟煤外，还可见到变质水平更高的无烟煤和天然焦。大部分煤为第三纪，烟煤和次烟煤为始新世和中新世，而褐一般为中新世，煤层厚度从0.3m以下到70m，一般为5~15m，特厚层为劣质煤，埋藏较浅，倾角较缓，煤质较硬，围岩较软，涌水量不大，瓦斯含量较低。
印尼缺少炼煤资源，但近期发觉，东加里曼丹一些地域的煤有炼焦特征，苏门答腊翁比林商挥发分烟煤的自由膨胀指数高达4，为“软”炼焦煤。印尼无烟煤储量为1亿t，占总储量的0.36%；烟煤52亿t，占14.38%；次烟煤97亿t，占26.63%；褐煤216亿t，占58.63%。
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